O rio é o principal da bacia hidrográfica do Vale do Ribeira e atravessa diversas outras cidades do estado de São Paulo, como: Registro, Pariquera-Açu, Barra do Chapéu, Itapirapuã Paulista, Apiaí e Ribeira. Apesar disso, não há risco de contaminação nesses municípios até o momento, segundo as autoridades.